ExaML考试 swMATH ID: 29594 软件作者： 科兹洛夫，A.M.，阿伯勒，A.J.，斯塔马塔基斯，A。 描述： ExaMl版本3：超级计算机上进行系统发育分析的工具。动机：谱系学越来越多地应用于医学和生物研究的所有领域。由于下一代测序革命，用于进行系统发育分析的数据集以前所未有的速度增长。我们提供ExaML版本3，这是一个专用的生产级代码，用于使用超级计算机推断全转录组和全基因组比对的系统发育。结果：我们介绍了对ExaML的几项改进和扩展：替代模型和支持的数据类型的扩展，新型负载平衡算法的集成，以及显著提高并行效率的并行I/O优化，以及基于Intel MIC的硬件平台的生产级实现。可用性和实现：代码在GNU GPL下的https://github.com/stamatak/ExaML。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4514929网址/ 源代码： https://github.com/stamatak/ExaML网站 相关软件： 三重MaxCut；气体；项目CAR；角度；NINJA公司；SVD请求；午睡；快速RFS；四重奏MaxCut；记录-I-DCM3；DACTAL公司；NJMerge公司；iGLASS系统；莫帕尔；ASTRID公司；巴克；姆特雷米克斯；HyDe公司；星熊2；RAxML公司；国际GTP 引用于： 1文件 1位作者引用 1 Tandy J.沃诺。 连载1篇 1 计算生物学 在3个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文