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PathCellNet:细胞类型特异性病原体反应网络探索者。病原体特异性免疫应答是几种固有免疫细胞和适应性免疫细胞类型之间的复杂相互作用。先天免疫细胞在病原体识别和启动抗原特异性适应性免疫应答中起关键作用。尽管先天免疫细胞具有特定的功能性作用,但它们共享多种抗病毒途径。然后问题变成,在不同细胞类型的病毒感染引起的转录变化中重叠是什么?在这里,我们通过基因转录数据的比较分析,探讨基因标记在先天免疫细胞类型中保守的程度。特别是,我们整合转录数据集测量两个先天免疫细胞(上皮细胞和树突状细胞)对流感病毒的反应。该研究揭示了细胞类型特异性调节基因和两种细胞类型之间的保守网络。此外,新的功能相关的基因簇被确定,有力地定义了多个独立的研究。这些基因簇可以用于未来的研究,并促进它们的使用,我们发布PathCellNet(版本0),一种基于云的工具,以探索细胞类型特异性连接的用户定义的基因。在将来,PACTCELNET的扩展将允许探索各种病原体和细胞类型的细胞类型特异性应答。