ATtRACT公司 swMATH ID: 29373 软件作者: Giudice G、Sánchez-Cabo F、Torroja C、Lara-Pezzi E 说明: ATtRACT-一个RNA结合蛋白和相关基序的数据库。RNA-binding proteins(RBPs)在关键的细胞过程中起着至关重要的作用,包括RNA转运、剪接、多聚腺苷化和稳定性。了解RBP和RNA之间的相互作用是提高我们对全球RNA加工、定位和调控知识的关键。尽管近年来取得了一些进展,但缺乏统一的非冗余资源,其中包括关于实验验证的基序、RBP和利用这些信息的集成工具的信息。在这里,我们开发了一个名为ATtRACT的数据库(可在网址:http:)它汇编了370个RBP和1583个RBP共有结合基序的信息,其中192个不存在于任何其他数据库中。为了填充ATtRACT,我们(i)从CISBP-RNA、SpliceAid–F、RBPDB数据库中提取并手工处理实验验证数据,(ii)整合并更新不可用的ASD数据库,以及(iii)通过计算分析从蛋白质数据库中的蛋白质-RNA复合物中提取信息。ATtRACT还提供了搜索特定模体和一次扫描一个或多个RNA序列的有效算法。它还允许发现在一组相关序列中丰富的从头基序,并将其与数据库中包含的基序进行比较。数据库URL:http://吸引。中国国际广播公司。锿 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4823821/ 相关软件: 动态记录仪;gplots(gplots);负原子;矩阵数据库;内部数据库;HuPho公司;miRNet(miRNet);小队;吉梅纳;线索GO;全球气候变化评估;雷德(Rede R);字符串db;阿尼莫;PRS公司;网络同步;SMPDB公司;路径蜂窝网;全球导航卫星系统;年战略 引用于: 1文件 2位作者引用 1 阿尔贝托·桑托斯·德尔加多 1 路易丝·冯·斯特肖 连载1篇 1 分子生物学方法 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文