sgnesR公司 swMATH ID: 29327 软件作者： Tripathi S、Lloyd-Price J、Ribeiro A、Yli-Harja O、Dehmer M、Emmert-Streib F 说明： sgnesR：一个R包，用于从考虑延迟参数的潜在真实基因网络结构中模拟基因表达数据。sgnesR（R中的随机基因网络表达模拟器）是一个R包，它提供了一个接口，可以使用随机模拟算法（SSA）模拟来自给定基因网络的基因表达数据。该软件包允许延迟参数的各种选择，并且可以很容易地包括在启动子延迟、RNA延迟和蛋白质延迟的反应中。用户可以调整这些参数来模拟细胞内的各种反应。作为示例，我们提供了两个网络模型来生成表达式配置文件。我们还演示了从生成的表达式剖面推断网络以及评估边缘和非边缘组件的关联度量。结果：sgnesR的目的是便于使用和快速实现，从可由用户选择的生物相关网络生成真实的基因表达数据。 主页： https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-017-1731-8 源代码： https://github.com/shaileshtripathi/sgnesR 依赖项： R（右） 相关软件： 特别行政区;KLU公司;法托德;RegulonDB公司;GeneNetWeaver;SIRENE公司;矩阵eQTL;NOMAD公司;路径2模型;SOSlib公司;拉西;BioPreDyn试验台;MMG公司;GeNGe公司;SGN模拟;IntaRNA;CopraRNA;国际评分;真诚;BGRMI公司 引用于： 1文件 2位作者引用 1 Huynh Thu，维安 1 吉多·桑吉内蒂 连载1篇 1 分子生物学方法 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文