SGN模拟 swMATH ID: 29325 软件作者： 里贝罗AS，Lloyd-Price J 描述： SGN-Sim，一个随机遗传网络模拟器。我们提出了SGNSim，即“随机基因网络模拟器”，这是一种建模基因调控网络（GRN）的工具，其中转录和翻译被建模为多个时间延迟事件，其动力学由能够处理多个时间延误事件的随机模拟算法（SSA）驱动。延迟可以从多种分布和复杂函数或物理参数的反应速率中得出。SGNSim可以在一组用户定义的参数（如拓扑）内生成GRN的集合。它还可以用于对特定的GRN和化学反应系统进行建模。也可以对诸如基因缺失、过度表达、复制和突变等干扰进行建模。例如，我们提出了一个不受干扰的合作结合的拨动开关模型，一个在分隔环境中的反应系统，其中膜交叉由负反馈机制控制，以及一个基于酵母转录网络的模拟。可用性：SGNSim程序，有关说明和示例，请访问www.ucalgary.ca/aribeiro/SGNtheSim/SGNtheSim.html。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17267430 相关软件： RegulonDB公司；特别行政区；克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢克卢；法托德；GeneNetWeaver公司；SIRENE公司；矩阵eQTL；NOMAD公司；路径2模型；SOSlib公司；拉西；BioPreDyn试验台；MMG公司；sgnesR公司；GeNGe公司；IntaRNA；CopraRNA；国际评分；信诺（SINCERITIES）；BGRMI公司 引用于： 7文件 全部的 前5名13位作者引用 5 安德烈·席尔瓦·里贝罗 三 奥利·尤利·哈贾 2 戴晓峰 2 安蒂·哈基宁 1 保罗·巴拉里尼 1 玛丽·杜弗洛特 1 JoséM·丰塞卡。 1 香农·希利 1 维安·胡恩·图恩 1 Meenakhisundaram坎德哈维鲁 1 贾诺·梅克尔 1 莱昂纳多·马丁斯 1 吉多·桑吉内蒂 5篇连载文章中引用 三 理论生物学杂志 1 数学生物科学 1 理论计算机科学 1 计算生物学和化学 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 7 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文