土豆泥 swMATH ID: 28785 软件作者： Ondov，B.D.等人。 描述： Mash：使用MinHash快速估计基因组和元基因组距离。Mash扩展了MinHash降维技术，将两两变异距离和P值显著性测试包括在内，实现了大规模序列集合的高效聚类和搜索。Mash将大型序列和序列集简化为具有代表性的小型草图，从中可以快速估计全局变异距离。我们展示了几个用例，包括在33个CPU h中对所有54118个NCBI RefSeq基因组进行聚类；使用组装或未组装的Illumina、Pacific Biosciences和牛津纳米孔数据进行实时数据库搜索；以及数百个宏基因组样本的可扩展聚类。Mash根据BSD许可证自由发布(https://github.com/marbl/mash网址). 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4915045网址/ 源代码： https://github.com/marbl/Mash网站 相关软件： github；海怪；MetaPhlAn公司；艺术；塞克特克；MetaPhyler公司；咨询-II；MLTreeMap（MLTree地图）；TIPP公司；克拉克；苹果；吵闹；SPAdes系列；KMC公司；仪表；艾根斯特拉；TreeCluster（树簇）；生物技术研究所；离心机；蝴蝶结2 引用于： 9文件 全部的 前5名35位作者引用 2 保罗·梅德韦杰夫 2 西亚瓦什·米拉拉布 1 马克·阿奇特曼 1 纳比尔·法里德·阿利坎 1 朱利叶斯·布斯 1 塞德里克·乔夫 1 Rayan Chikhi 1 列奥尼德·钦德列维奇 1 阿菲夫·埃尔格拉乌伊 1 范伟通路易斯 1 佩德罗·费约 1 小威廉 1 莫森·卡特比 1 大卫·科斯利基 1 拉西恩 1 莱杰德·布兰登 1 尼娜·卢曼 1 梅赫达·曼苏里 1 Reza Miraskarshahi 1 马修·阮 1 克里斯托弗·昆斯 1 Eleonora Rachtman公司 1 阿马图·拉赫曼 1 塞巴斯蒂安·罗奇 1 彼得·里沙夫 1 克里斯托弗·萨林 1 ⑩阿里·奥斯曼·伯克（Ali Osman Berk），apc 1 斯威顿，亚历克斯 1 克里斯特·斯文森（Krister M.Swenson）。 1 法拉马茨·瓦拉法 1 马蒂亚斯·韦勒 1 Johnathan Wong先生 1 胡曼·扎贝蒂 1 Zhi elezn，Filip先生 1 周哲敏 3篇连载文章中引用 1 应用数学与计算 1 应用概率年鉴 1 数据挖掘与知识发现 在3个字段中引用 8 生物学和其他自然科学（92-XX） 三 统计学（62-XX） 2 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文