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iUbiq-Lys系统

swMATH ID: 27670
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说明: iUbiq-Lys:通过灰色系统模型提取序列进化信息,预测蛋白质中的赖氨酸泛素化位点。泛素化作为最重要的翻译后修饰(PTM)之一,在信号转导、细胞分裂、凋亡和免疫反应等多种生物过程中发挥着重要的调节作用。泛素化也被称为“赖氨酸泛素化”,因为它发生在泛素共价连接到靶向蛋白的赖氨酸(K)残基上时。给定一个含有许多赖氨酸残基的无特征蛋白质序列,其中哪个是泛素化位点,哪个是非泛素化部位?随着后基因组时代产生的蛋白质序列的大量涌现,基础研究和药物开发都迫切需要开发一种快速准确注释蛋白质泛素化位点的自动化方法。鉴于此,基于进化信息、灰色系统模型以及伪氨基酸组成的一般形式,开发了一种新的预测因子“iUbiq-Lys”。通过严格的交叉验证证明,新的预测值显著优于所有对应的预测值。作为一个网络服务器,公众可以访问iUbiq-Lyshttp://www.jci-bioinfo.cn/iUbiq-Lys . 为了方便大多数实验科学家,我们进一步提供了一个循序渐进的指导协议,通过该协议,用户可以很容易地获得他们想要的结果,而无需遵循本文中提出的复杂数学,只是为了其开发过程的完整性。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25248923
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8 理论生物学杂志

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