PSOFuzzySVM-TMH公司 swMATH ID: 27664 软件作者： Hayat M，Tahir M。 描述： PSOFuzzySVM-TMH：采用集成模糊支持向量机的集成特征空间识别跨膜螺旋段。膜蛋白是细胞的核心成分，负责管理细胞内外过程。膜蛋白执行对生物体生存至关重要的多种功能。跨膜蛋白的拓扑结构描述了跨膜（TM）螺旋片段的数量及其方向。然而，由于缺乏可识别的结构，通过实验方法识别TM螺旋及其拓扑结构是困难的，并且吞吐量低。为了从拓扑序列中可靠、准确、有效地识别TM螺旋片段，我们提出了PSOFuzzySVM-TMH模型。在该模型中，使用基于进化的信息位置特异性评分矩阵和基于离散的信息6字母交换组来构建跨膜蛋白序列。使用优化选择技术，即粒子群优化，从两个特征空间中消除噪声和无关属性。最后，将选定的特征空间进行组合，形成集成特征空间。采用模糊支持向量机作为分类算法。使用了两个基准数据集，包括低分辨率和高分辨率数据集。在不同水平上，通过10倍交叉验证测试评估PSOFuzzySVM-TMH模型的性能。实证结果表明，所提出的框架PSOFuzzySVM-TMH在检测数据集的分类性能方面优于其他框架。可以肯定的是，该模型可能是学术界和研究界进一步研究跨膜蛋白结构和功能的有用和高通量工具。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26054033 相关软件： PseKNC公司;综合布线;iPTM-mLys公司;iRNA心理健康;iHyd-PseAAC公司;PSNO公司;iUbiq-Lys系统;2L-piRNA;iDNA6mA-PseKNC公司;pLoc-mHum（位置-湿度）;iRNA心理健康单位;iRNAm5C PseDNC公司;iRNA-2甲基;pLoc-mEuk公司;iPhos-PseEn公司;邻硝基-Tyr;iSNO-PseAAC公司;iMethyl-PseAAC（异甲基苯丙酮）;iRNA-甲基;iRSpot-PseDNC公司 引用于： 3文件 5位作者引用 2 马苏德·海亚特 1 沙希德·阿克巴 1 法曼阿里 1 Chong，Kil To村 1 希拉·塔亚拉 连载1篇 三 理论生物学杂志 在2个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文