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pLoc-mHum(位置-湿度)

swMATH ID: 27661
软件作者: Cheng,X。;Xiao,X。;周,K.-C。
描述: pLoc-mHum:通过通用PseAAC预测多位置人类蛋白质的亚细胞定位,以筛选出关键的GO信息。动机:为了深入了解蛋白质在细胞中的功能,了解其亚细胞定位是必不可少的。目前的研究主要集中在仅基于序列信息的人类蛋白质亚细胞位置预测。尽管在这方面已经作出了相当大的努力,但这个问题远未得到解决。大多数现有方法只能用于处理单位置蛋白质。实际上,具有多个位置的蛋白质可能具有一些特殊的生物功能,这些功能对基础研究和药物设计都特别重要。结果:利用多标记理论,我们通过将关键的GO(基因本体)信息提取到一般PseAAC(伪氨基酸组成)中,提出了一种新的预测因子“pLoc-mHum”。在同样严格的基准数据集上进行的严格交叉验证表明,所提出的pLoc-mHum预测因子在预测人类蛋白质亚细胞定位方面明显优于iLoc-Hum这一最先进的方法。可用性和实现:为了最大限度地方便大多数实验科学家,已在http://www.jci-bioinfo.cn/pLoc-mHum/,用户可以很容易地获得他们想要的结果,而不需要经历复杂的数学运算。
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/9/1448/4587586
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