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swMATH ID: 27124
软件作者: Teshima,K.M。;Innan,H。
说明: mbs:修改Hudson的ms软件,生成具有双等位基因位点的DNA序列样本。背景:单核苷酸多态性(SNP)模式包含了大量关于物种微观进化过程机制的信息。包括自然选择在内的这些机制的作用的推断在很大程度上依赖于计算机模拟。当所有突变均为中性时,合并模拟在从种群(物种)中生成大量DNA序列样本方面非常强大,而Hudson的ms软件经常用于此目的。然而,很难将自然选择纳入合并框架。结果:我们在此提出了一个软件应用程序,用于在存在选择的双等位基因位点时生成DNA序列样本。该软件应用程序称为mbs,是通过修改Hudson的ms开发的。mbs软件非常灵活,可以包含任何种群规模变化的任意历史记录和任何选择模式,只要选择是在双等位基因网站上进行的。结论:mbs为研究不同人口学特征下任何选择方式对SNP模式的影响提供了机会。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2693440/
相关软件: MSMS(座椅位置记忆系统)
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