猎鹰

FALCON:一个分析二部网络嵌套性的软件包。嵌套度是一种统计方法,用于解释生物地理学(物种-地点关系)和物种相互作用(植物传粉者和寄主-寄生虫网络)中的二部相互作用数据。有多种方法被用来评估嵌套性,它们在如何确定嵌套性的度量方面有所不同。此外,还使用了几种不同的零模型来计算嵌套得分的统计显著性。大量的度量和零模型,其中许多给出了相互矛盾的结果,对于不同研究中的嵌套性比较是有问题的。我们开发了FALCON软件包,可以方便有效地比较给定输入网络的嵌套得分和统计显著性,使用当前文献中比较流行的度量和空模型。FALCON目前包括六个度量和五个零模型来度量二元网络中的嵌套,以及两个度量和四个零模型来度量加权网络中的嵌套性。猎鹰软件的设计是高效和易于使用。FALCON代码以三种语言(R、MATLAB、Octave)提供,设计为模块化和可扩展性,使用户可以通过添加进一步的度量和空模型轻松扩展其功能。FALCON提供了一种稳健的方法来比较给定二部网络中嵌套的强度和重要性,使用多个度量和零模型。它包括一个“自适应集成”方法,以减少计算统计显著性时零分布的欠采样。它可以用于二进制或加权输入网络。FALCON是对文献中各种嵌套度量和相关零模型的一种回应。它允许使用不同的方法简单有效地计算嵌套得分和统计显著性,从而能够比较不同研究的结果,从而支持在不同生物背景下嵌套的原因和影响的理论研究。

ZBMaCT中的参考文献(1篇文章中提到)

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  1. 任卓明;曾安;张义成:复杂网络中面向结构的预测(2018)