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NR-2L型

swMATH ID: 26879
软件作者: Wang P、Xiao X、Chou KC
描述: NR-2L:基于序列衍生特征识别核受体亚家族的两级预测因子。核受体是动物体内最丰富的转录调控因子之一。它们调节多种功能,如体内平衡、生殖、发育和新陈代谢。因此,NRs是药物开发的一个非常重要的靶点。核受体是一个与系统发育相关的蛋白质超家族,由于其结构域的多样性,已被细分为不同的亚家族。在这项研究中,开发了一种称为NR-2L的两级预测因子,它可以用于识别查询蛋白是否为核受体,也可以不基于其序列信息;如果是,预测将自动继续,以在以下七个亚家族中进一步确定:(1)甲状腺激素样(NR1),(2)HNF4样(NR2),(3)雌激素样,(4)神经生长因子IB样(NR4),(5)福氏tarazu-F1样(NR5),(6)生殖细胞核因子样(NR6),和(7)刀刃样(NR0)。基于伪氨基酸组成的模糊K最近邻分类器(FK-NN)进行识别,伪氨基酸组成由蛋白质序列衍生的各种物理化学和统计特征组成,如氨基酸组成、二肽组成、复杂性因子、,和低频傅里叶频谱成分。作为证明,通过从NucleaRDB和UniProt中获得的低冗余度基准数据集可以看出,折刀测试的总体成功率约为93
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/提交/1858146
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