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MITOPRED公司

swMATH ID: 26856
软件作者: 古达,C。;古达,P。;Fahy,E。;南部Subramaniam
描述: MITOPRED:预测线粒体蛋白质的网络服务器。MITOPRED网络服务器能够预测所有真核生物中细胞核编码的线粒体蛋白。使用一种新算法进行预测,该算法主要基于线粒体和非线粒体位置的Pfam域发生模式。对酿酒酵母、秀丽隐杆线虫、果蝇、智人、小家鼠和拟南芥的蛋白质组以及瑞士-Prot和TrEMBL数据库中的所有真核生物序列进行预先计算的预测都可以立即获得。在不同的置信水平下,可以通过四种不同的选项进行查询:(i)输入Swiss-Prot/TrEMBL登录号;(ii)上传具有此类登录号的本地文件;(iii)输入蛋白质序列;(iv)上传包含FASTA格式蛋白质序列的本地文件。计划对预先计算的预测数据库进行自动更新,以提供对最新数据的访问。服务器、其文档和数据可从http://mitopred.sdsc.edu。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC441512/
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