信号CF

信号CF:一种用于预测信号肽的子网站耦合和窗口融合方法。我们开发了一种自动预测真核生物和细菌蛋白质序列中信号肽序列及其裂解位点的方法。它是一个2层预测器:第一层预测引擎将查询的蛋白质识别为分泌型或非分泌型;如果是分泌型,则该过程将自动与第二层预测引擎继续进行,以进一步识别其信号肽的裂解位点。新的预测器被称为信号CF,其中C代表“耦合”,F代表“融合”,这意味着信号CF是通过融合沿着蛋白质序列的子站点耦合效应以及通过投票系统融合来自多个宽度不同的缩放窗口的结果而形成的。信号CF具有预测成功率高、计算时间短的特点,特别适用于大规模数据集的分析。网址http://bioMed.inf.Signal/http://bioMed.inf.Signal/http://www.bioMed.inf/CF免费获取http://bioMed.inf.Signal/http://www.bioMed.inf/CF。


zbMATH参考文献(引用于 29篇文章

显示第1到第20个结果,共29个。
按年份排序(引用)
  1. Georgiou,D.N.;Karakasidis,T.E.;Megaritis,A.C.;Nieto,Juan J.;Torres,A.:遗传序列比较的模糊拓扑方法的扩展(2015)
  2. Massahi,Aslan;Ch alık,Pınar:用于胞外重组蛋白生产的Pichiapatoris信号肽的电子测定(2015)
  3. Chen,Xiao;Peng,Qinke;Han,Libin;Zhong,Tao;Xu,Tao:一种基于超图划分的有效单倍型装配算法(2014)
  4. Wan,Shibiao;Mak,Man Wai;Kung,Sun Yuan:R3P-Loc:一种使用岭回归和随机投影进行蛋白质亚细胞定位的紧凑多标记预测因子(2014)
  5. 徐燕;王晓波;王永翠;田英杰;邵晓健;吴凌云;邓乃阳:用核方法预测氨基酸序列的翻译后修饰位点(2014)
  6. Mishra,Pooja;Nath Pandey,段落:基于相互信息的Elman RNN蛋白质序列分类(2012年)
  7. Cheng,Feng;Theodorescu,Dan;Schulman,Ira G.;Lee,Jae K.:\texitinvitro转录组学预测早期药物发现的肝毒性(2011年)
  8. Kavousi,Kaveh;Moshiri,Behzad;Sadeghi,Mehdi;Araabi,Babak N.;Moosavi Movahedi,Ali Akbar:通过PSSM融合不同模式的伪氨基酸组成而形成的蛋白质折叠分类器(2011年)
  9. Esmaeili,Maryam;Mohabatkar,Hassan;Mohsenzadeh,Sasan:使用Chou的伪氨基酸组成概念预测人乳头瘤病毒的风险类型(2010年)
  10. Georgiou,D.N.;Karakasidis,T.E.;Nieto,Juan J.;Torres,A.:使用度量空间和模糊集研究遗传序列的熵/清晰度(2010)
  11. 黄伟;张建民;王玉荣;黄丹:一种基于模糊理论的生物序列相似性分析的简单方法(2010)
  12. Nanni,Loris;Brahnam,Sheryl;Lumini,Alessandra:PseAAC和基于序列的蛋白质分类描述符集(2010)
  13. Nanni,Loris;Shi,Jian Yu;Brahnam,Sheryl;Lumini,Alessandra:使用从蛋白质主干图像中提取的纹理描述符进行蛋白质分类(2010)
  14. 杨洁;李佳煌;王,金;张,陈宇:糖酵解与凋亡整合之线粒体中不良复合物之分子模拟(2010)
  15. 杨连平;张向德;王天明:基于Burrows-Wheeler变换的生物序列间Burrows-Wheeler相似性分布(2010)
  16. 俞乐正;郭彦志;李,宜州;李公兵;李梦龙;罗,杰思;熊,文佳;秦,雯丽:分泌:通过将新特征融合到周的伪氨基酸组成中来识别细菌分泌的蛋白质(2010)
  17. Anand,Ashish;Suganthan,P.N.:基于支持向量机的多类癌症分类和分类优化基因和概率估计(2009)
  18. Choo,Khar Heng;Tan,Tin Wee;Ranganathan,Shoba:N-末端信号肽预测方法的综合评估(2009)ioport公司
  19. Frenkel,Zakharia M.;Frenkel,Zeev M.;Trifonov,Edward N.;Snir,Sagi:蛋白质序列空间中通过流网络的结构相关性(2009年)
  20. Georgiou,D.N.;Karakasidis,T.E.;Nieto,J.J.;Torres,A.:使用模糊聚类技术和矩阵对氨基酸进行分类及其对周氏伪氨基酸组成的影响(2009年)