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GRETNA公司

swMATH ID: 26509
软件作者: 王J、王X、夏M、廖X、埃文斯A、何Y
描述: GRETNA:用于成像连接组学的图论网络分析工具箱。最近的研究表明,大脑的结构和功能网络(即连接组学)可以通过各种成像技术(如EEG/MEG;结构、扩散和功能MRI)构建,并通过图论进一步表征。考虑到网络构建、分析和统计的巨大复杂性,包含这些功能的工具箱在很大程度上是缺乏的。在这里,我们开发了用于成像连接组学的GRaph thEoreTical Network Analysis(GRETNA)工具箱。GRETNA包含以下几个关键功能:(i)一个开源、基于Matlab的跨平台(Windows和UNIX OS)软件包,带有图形用户界面(GUI);(ii)允许对全局和局部网络属性进行拓扑分析,并具有并行计算能力,与成像方式和种类无关;(iii)在网络构建和分析的几个关键步骤中提供灵活的操作,包括网络节点定义、网络连接处理、网络类型选择和阈值化过程的选择;(iv)允许对全球、节点和连接网络指标进行统计比较,并评估这些网络指标与感兴趣的临床或行为变量之间的关系;和(v)包括基于静止状态功能MRI(R-fMRI)数据的图像预处理和网络构建功能。在将GRETNA应用于公开发布的54名健康年轻人的R-fMRI数据集后,我们证明了人脑功能网络展现出高效的小世界、分类、层次和模块化组织,并拥有高度连接的中枢,并且这些发现对不同的分析策略具有鲁棒性。通过这些努力,我们预计GRETNA将以简单、快速和灵活的方式加速成像连接组学。GRETNA在NITRC网站上免费提供。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26175682
源代码:  https://github.com/sandywang/GRETNA网站
相关软件: 大脑连接工具箱;BRAPH公司;巴斯科;全球技术集团;BrainNet查看器;电子连接时间;连接器;动态BC;BSMART公司;Matlab公司;图形变量
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