竹子 swMATH ID: 26313 软件作者： Li Q、Dahl DB、Vannucci M、Hyun Joo、Tsai JW 描述： 用于二级结构预测的蛋白质一级序列贝叶斯模型。测定蛋白质的一级结构（即氨基酸序列）变得更便宜、更快、更准确。高阶蛋白质结构可以深入了解蛋白质在细胞中的功能。了解蛋白质的二级结构是实现这一目标的第一步。因此，已经发展了许多计算预测方法，仅从一级氨基酸序列预测二级结构。最成功的方法使用的机器学习方法非常准确，但不直接包含结构信息。作为改进给定初级结构的二级结构约简的一步，我们提出了一个基于二级结构中蛋白质包装的knob-socket模型的贝叶斯模型。该方法考虑了残留物对二级结构测定的影响，包括空间近但顺序远的残留物。通过在两个测试集上对我们的方法进行评估，我们展示了与PSIPRED类似的多序列比对数据的合并如何提供平衡并提高预测的准确性。实现这些方法的软件作为web应用程序和独立实现提供 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25314659 源代码： https://github.com/dbdahl/竹 相关软件： 葱头；起重机；rscala公司；MLlib（MLlib）；火花；闪耀之星；SDOL（系统数据仓库）；Rserve公司；R调用方；卢比；rJava软件；斯卡拉；火花；R（右）；伦敦银行支持向量机；kknn公司；微风；序数群；有序森林；勒莫 引用于： 0个文档