根赛 swMATH ID: 25985 软件作者: Robert Cimrman,Zbyněk Tonar,Petra Kochová 描述: gensei=串行图像生成器。该软件用于通过充满椭球体、圆柱体和纤维的体积生成一系列二维截面,这些体积具有先验已知的统计特性。为了表示组织结构的模型,例如形成生物组织的细胞外基质的细胞和纤维,可以生成任意系列的图像。这些图像表示连续切片或以系统统一的方式采样的切片。用户可以设置三维对象类别的数量和类型(椭球体、圆柱体)、参考体积的尺寸、生成图像的大小、要生成的对象和截面的数量、对象的长宽比和体积分数。可以通过相同的参考体积和相同的物体生成三个垂直的截面系列,从而测试物体的各向同性。模拟输出存储为三系列图像文件以及包含生成对象统计特性的详细报告,即每类对象的数量、参考体积内对象的体积分数、对象的表面密度、,对象和截面之间的交点数量,以及对象围绕唯一确定的空间矢量的旋转。通过比较体积、表面和长度的真实估算值和基于截面的估算值,可以测试用于估算的各种体视网格的设置。用户可以例如模拟截面厚度对体积、表面和长度的立体估计的影响。生成的图像具有高对比度,因此可以分割对象。 主页: http://docs.sfepy.org/gensei/doc-devel/ 源代码: https://github.com/rc/gensei网址 相关软件: 蟒蛇;拔管器 引用于: 1文件 5位作者引用 1 罗伯特·西姆曼 1 Janáckek,Jiří 1 佩特拉·科乔娃 1 托纳尔,兹宾克 1 柯斯蒂·维特 连载1篇 1 理论生物学杂志 在2个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文