规则数据库

RealOnDB(第6版):大肠杆菌K-12基因转录调控模型,转录,活性(实验)注释启动子和文本导航。RegulonDBHTTP://RealNordB.cc.UNAM.MX/MX/是主要的参考数据库,提供对大肠杆菌K12的转录调控网络的精明知识,目前是已知的任何自由生物有机体的基因调控网络的电子编码数据库。本文总结了改进,新的生物学和新的特点,可在6版。从现在开始,对每一个新版本的原创文学的编纂都是最新的。所有的对象都由其相应的证据支持,现在被分类为强或弱。转录因子根据它们的效应物的来源和基因本体类进行分类。现在我们已经计算了54个和五个不同的启动子类型的西格玛70族及其相应的10和35个盒子的计算预测。除了那些来自文献的作者,我们添加了大约300个来自我们自己的高通量映射努力的实验映射的启动子。RealOnDB V.6现在扩展到转录起始,包括RNA调节元件,特别是核糖开关、衰减器和小RNAs,以及它们已知的相关靶点。数据可以通过对基因调控的相关性的概览来访问。可以使用TrimeScript文本挖掘引擎搜索正则数据库关联的原始文献,以及超过4000个注释注释。


ZBMaCT中的参考文献(46篇文章中引用)

显示结果1至20的46。
按年份排序(引文
  1. Sanguinetti,Guido(ED);Huynh Thu,V·N Anh(ED):基因调控网络。方法与协议(2019)
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  16. Redondo Nieto,米格尔;Arroyo,费尔南多;Castellanos,胡安:通过工程细菌逻辑门的生物电路设计(2011)伊波尔特
  17. Mabrouki,Mbarka;艾吉尔,贾景晖;彗星,Jean Paul;勒加尔,Pascale;李察,阿德里安:生物调控网络的嵌入和财产保全(2011)
  18. Roverato,阿尔伯托;Di LasCIO,F. Marta L.:基因聚类的威尔克斯’(λ)不同度量:基于转录模块识别的方法(2011)
  19. Cerulo,路易吉;Elkan,查尔斯;CeCall Li,米歇尔:仅从正和未标记数据中学习基因调控网络(2010)伊波尔特
  20. Berkin马尔科科,Duygu巴尔干;厄尔赞,艾伊:基于信息内容的TexTeTeSeCiCeCaloi基因调控网络拓扑性质模型(2010)