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RegulonDB公司

swMATH ID: 25948
软件作者： Gama-Castro，S。；Jimenez-Jacinto，V。；佩拉塔·吉尔，M。；Santos-Zavaleta，A。；佩尼亚洛扎·斯皮诺拉，M.I。；孔特雷拉斯·莫雷拉，B。；Segura-Salazar，J。；Muñiz-Rascado，L。；马丁内斯·弗洛雷斯，I。；萨尔加多，H。；Bonavides-Martinez，C。；Abreu-Goodger，C。；罗德里格斯-佩纳戈斯，C。；Miranda-Ríos，J。；Morett，E。；梅里诺，E。；韦尔塔，A.M。；Treviño-Quintanilla，L.公司。；Collado Vides，J。
描述： RegulonDB（6.0版）：大肠杆菌K-12超越转录、活性（实验）注释启动子和Textpresso导航的基因调控模型。RegulonDB公司(http://regulondb.ccg.unam.mx/)是一个主要参考数据库，提供大肠杆菌K12转录调控网络的精选知识，目前是任何自由生活生物体遗传调控网络最著名的电子编码数据库。本文总结了6.0版中的改进、新生物学和新功能。从现在起，每一个新版本的原创文学都是最新的。所有的物体都有相应的证据支持，现在分为强证据和弱证据。转录因子根据其效应器的来源和基因本体类进行分类。我们现在已经对σ54和σ70家族的五种不同启动子类型及其相应的−10和−35框进行了计算预测。除了从文献中筛选的启动子外，我们还添加了大约300个来自我们自己的高通量绘制工作的实验绘制的启动子。RegulonDB v.6.0现在扩展到转录起始之外，包括RNA调节元件，特别是核糖开关、衰减器和小RNA，以及它们已知的相关靶点。这些数据可以通过对基因调控相关性的概述来访问。现在可以使用Textpresso文本挖掘引擎搜索RegulonDB相关的原始文献以及4000多份策展笔记
主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2238961/
相关软件： KEGG公司；阿拉伯国家石油公司；GeneNetWeaver公司；R（右）；Web徽标；JASPAR公司；细胞景观；丁戈；玻璃制品；GeNGe公司；同步TReN；SIRENE公司；SGN模拟；生物网格；答对 了；科帕西；TRANSFAC公司；BioProspector公司；HPAM公司；MetaCyc公司
引用于： 30文件
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94位作者引用

2 Jean-Paul彗星
2 尤拉姆·卢佐恩
2 奇库·奥萨瓦
2 理查德·阿德里安
1 马克·艾吉尔
1 伊奥安尼斯·安德鲁拉基斯（Ioannis P.Androulakis）。
1 杜伊古·巴尔坎
1 吉尔斯·伯诺
1 马坦·博达克
1 蔡玉东
1 曹志伟
1 马达丽娜·查夫斯
1 Cherry，Joshua L。
1 朱利奥·科拉多·维德斯
1 科蒂克，V。
1 扎赫·达维
1 弗莱德里克·达扬
1 谢拉·德·阿维拉·席尔瓦
1 Di Lascio，F.Marta L。
1 阿戈斯蒂诺·多维尔
1 杜海峰
1 塞尔吉奥·埃切韦里加雷
1 艾什·埃尔赞
1 费迪南多·菲奥雷托
1 JoséM·丰塞卡。
1 Panagiota T·Foteinou。
1 弗里尔，尼尔
1 格哈特，Günther J.L。
1 龚茂国
1 Jean-Luc Gouzé
1 安蒂·哈基宁
1 巴沃尔·哈努斯
1 艾莉森·希思。
1 维安·胡恩·图恩
1 Ierepatritou，Marianthi G。
1 雅各布·J·卡根。
1 Meenakhisundaram坎德哈维鲁
1 利迪亚·卡夫拉基。
1 德克·科什图茨基
1 克里希南，耶亚什利
1 朱莉娅·克鲁什卡尔
1 帕斯卡尔·勒加尔
1 李倩忠
1 李毅雪
1 林浩
1 德里克·罗夫利。
1 罗清明
1 马丽嘉
1 姆巴卡·马布罗基
1 加西姆·马赫德瓦尔
1 贾诺·梅克尔
1 贝尔金·马尔科奇
1 阿古斯蒂诺·马丁内斯·安东尼奥
1 莱昂纳多·马丁斯
1 Barbara A.Methé。
1 爱德华多·米特拉尼
1 雅各布·C·米勒。
1 阿巴斯·诺扎里·达里尼
1 奥利维拉、比阿特丽斯·凯莉·卢娜
1 潘伟
1 埃内斯托·佩雷兹·鲁埃达
1 恩里科·蓬泰利
1 安德烈·席尔瓦·里贝罗
1 罗梅罗·扎利兹。
1 尤纳坦·罗森
1 阿尔贝托·罗维拉托
1 梅迪·萨德吉
1 Georgios K.D.Saharidis。
1 吉多·桑吉内蒂
1 Michael A.Savageau。
1 约纳坦·萨维尔
1 福尔克·施赖伯
1 安德烈亚斯·舒伯特。
1 海宁Schwöbbermeyer
1 洛伦佐·塞戈维亚
1 孙义祥
1 川弘武本
1 谭和利
1 Tan，Linda S.L。
1 特拉斯蒂，茨维
1 雷扎托拉比
1 埃德加多·乌加尔德
1 王珊凤
1 魏鹏
1 约翰娜·温德尔
1 严斌
1 埃里克·杨
1 奥利·尤利·哈贾
1 袁、湛江
1 尤尔根·泽奇
1 张国庆
1 张佳军
1 周天寿
1 伊戈尔·兹维尔
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18篇连载文章中引用

10 理论生物学杂志
2 物理A
2 计算生物学和化学
1 数学生物学杂志
1 统计物理杂志
1 数学生物科学
1 数学生物学通报
1 生物计量学
1 模糊集与系统
1 物理D
1 全球优化杂志
1 国际应用科学与工程分叉与混沌杂志
1 美国计算机学会模型和计算机仿真汇刊
1 计算机科学中的数学
1 应用统计学年鉴
1 计算与图形统计杂志
1 计算机科学评论
1 分子生物学方法
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10个领域引用

28 生物学和其他自然科学（92-XX）
5 统计学（62-XX）
5 计算机科学（68至XX）
5 运筹学、数学规划（90-XX）
2 组合数学（05-XX）
1 数理逻辑与基础（03-XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 数值分析（65-XX）
1 统计力学，物质结构（82-XX）
1 博弈论、经济学、金融学以及其他社会和行为科学（91-XX）

按年份列出的引文