RegulonDB公司 swMATH ID: 25948 软件作者： Gama-Castro，S。；Jimenez-Jacinto，V。；佩拉尔塔·吉尔，M。；Santos-Zavaleta，A。；佩尼亚洛扎·斯皮诺拉，M.I。；孔特雷拉斯·莫雷拉，B。；Segura-Salazar，J。；Muñiz-Rascado，L。；马丁内斯·弗洛雷斯，I。；萨尔加多，H。；Bonavides-Martinez，C。；Abreu-Goodger，C。；罗德里格斯-佩纳戈斯，C。；Miranda-Ríos，J。；Morett，E。；梅里诺，E。；韦尔塔，A.M。；Treviño-Quintanilla，L。；科拉多·维德斯，J。 说明： RegulonDB（6.0版）：大肠杆菌K-12超越转录、活性（实验）注释启动子和Textpresso导航的基因调控模型。RegulonDB公司(http://regulondb.ccg.unam.mx/)是一个主要参考数据库，提供大肠杆菌K12转录调控网络的精选知识，目前是任何自由生活生物体遗传调控网络最著名的电子编码数据库。本文总结了6.0版本中的改进、新生物学和新功能。从现在起，每一个新版本的原创文学都是最新的。所有的物体都有相应的证据支持，现在分为强证据和弱证据。转录因子根据其效应器的来源和基因本体类进行分类。我们现在已经对σ54和σ70家族的五种不同启动子类型及其相应的−10和−35框进行了计算预测。除了那些来自文献的策划，我们还添加了大约300个来自我们自己的高通量绘图工作的实验绘制的启动子。RegulonDB v.6.0现在扩展到转录起始之外，包括RNA调节元件，特别是核糖开关、衰减器和小RNA，以及它们已知的相关靶点。这些数据可以通过对基因调控相关性的概述来访问。现在可以使用Textpresso文本挖掘引擎搜索RegulonDB相关的原始文献以及4000多份策展笔记 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2238961/ 相关软件： KEGG公司;阿拉伯国家石油公司;GeneNetWeaver;R（右）;Web徽标;贾斯帕;细胞景观;丁戈;玻璃制品;GeNGe公司;同步TReN;SIRENE公司;SGN模拟;生物网格;答对 了;科帕西;TRANSFAC公司;BioProspector公司;HPAM公司;MetaCyc公司 引用于： 30文件 全部的 前5名94位作者引用 2 Jean-Paul彗星 2 尤拉姆·卢佐恩 2 奇库·奥萨瓦 2 理查德·阿德里安 1 马克·艾吉尔 1 伊奥安尼斯·安德鲁拉基斯（Ioannis P.Androulakis）。 1 杜伊古·巴尔坎 1 吉尔斯·伯诺 1 马坦·博达克 1 蔡玉东 1 曹志伟 1 马达丽娜·查夫斯 1 Cherry，Joshua L。 1 朱利奥·科拉多·维德斯 1 科蒂克，V。 1 扎赫·达维 1 弗莱德里克·达扬 1 谢拉·德·阿维拉·席尔瓦 1 Di Lascio，F.Marta L。 1 阿戈斯蒂诺·多维尔 1 杜海峰 1 塞尔吉奥·埃切韦里加雷 1 艾什·埃尔赞 1 费迪南多·菲奥雷托 1 JoséM·丰塞卡。 1 Panagiota T·Foteinou。 1 菲利尔、尼亚尔 1 格哈特，Günther J.L。 1 龚茂国 1 Jean-Luc Gouzé 1 安蒂·哈基宁 1 帕沃尔哈努斯 1 艾莉森·希思。 1 Huynh Thu，维安 1 Ierepatritou，Marianthi G。 1 雅各布·J·卡根。 1 Meenakhisundaram坎德哈维鲁 1 利迪亚·卡夫拉基。 1 德克·科什图茨基 1 克里希南，耶亚什利 1 朱莉娅·克鲁什卡尔 1 勒加尔，帕斯卡尔 1 李倩忠 1 李一雪 1 林浩 1 德里克·罗夫利。 1 罗清明 1 马丽嘉 1 姆巴卡·马布罗基 1 加西姆·马赫德瓦尔 1 贾诺·梅克尔 1 贝尔金·马尔科奇 1 马丁内斯·安东尼奥·阿古斯蒂诺 1 莱昂纳多·马丁斯 1 Barbara A.Methé。 1 爱德华多·米特拉尼 1 雅各布·C·米勒。 1 阿巴斯·诺扎里·达里尼 1 奥利维拉、比阿特丽斯·凯莉·卢娜 1 潘伟 1 埃内斯托·佩雷兹·鲁埃达 1 恩里科·蓬泰利 1 安德烈·席尔瓦·里贝罗 1 罗梅罗·扎利兹。 1 尤纳坦·罗森 1 阿尔贝托·罗维拉托 1 梅迪·萨德吉 1 Georgios K.D.Saharidis。 1 吉多·桑吉内蒂 1 Michael A.Savageau。 1 约纳坦·萨维尔 1 福尔克·施赖伯 1 安德烈亚斯·舒伯特。 1 海宁Schwöbbermeyer 1 洛伦佐·塞戈维亚 1 孙义祥 1 川弘武本 1 谭和利 1 Tan，Linda S.L.（琳达·S·L·谭）。 1 Tlusty，茨维 1 雷扎·托拉比 1 埃德加多·乌加尔德 1 王珊凤 1 魏鹏 1 约翰娜·温德尔 1 严斌 1 杨，埃里克 1 奥利·尤利·哈贾 1 袁、湛江 1 于尔根泽奇 1 张国庆 1 张佳军 1 周天寿 1 伊戈尔·兹维尔 全部的 前5名18篇连载文章中引用 10 理论生物学杂志 2 物理A 2 计算生物学和化学 1 数学生物学杂志 1 统计物理杂志 1 数学生物科学 1 数学生物学通报 1 生物计量学 1 模糊集与系统 1 物理D 1 全球优化杂志 1 国际应用科学与工程分叉与混沌杂志 1 美国计算机学会模型和计算机仿真汇刊 1 计算机科学中的数学 1 应用统计学年鉴 1 计算与图形统计杂志 1 计算机科学评论 1 分子生物学方法 全部的 前5名10个领域引用 28 生物学和其他自然科学（92-XX） 5 统计学（62-XX） 5 计算机科学（68至XX） 5 运筹学、数学规划（90-XX） 2 组合数学（05-XX） 1 数学逻辑和基础（03-XX） 1 概率论与随机过程（60-XX） 1 数值分析（65-XX） 1 统计力学，物质结构（82-XX） 1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学（91-XX） 按年份列出的引文