GBOOST公司 swMATH ID: 25801 软件作者： Yung LS1、Yang C、Wan X、Yu W。 描述： GBOOST：一种基于GPU的工具，用于检测全基因组病例对照研究中的基因-基因相互作用。利用先进的基因分型技术收集数百万个基因变异是可行的。随着大量遗传变异数据的掌握，开发高效的算法及时进行基因-基因相互作用分析已成为全基因组关联研究（GWAS）的关键问题之一。基于布尔运算的筛选和测试（BOOST）是GWAS最近的一项工作，在台式计算机上用2.5天的时间完成了基因相互作用分析。与中央处理器（CPU）相比，图形处理单元（GPU）是高度并行的硬件，提供大量计算资源。因此，我们有动机使用GPU来进一步加快基因-基因相互作用的分析。结果：我们基于GPU框架实现了BOOST方法，并将其命名为GBOOST。与BOOST相比，GBOOST实现了40倍的加速。在配备Nvidia GeForce GTX 285显示卡的台式计算机上，它在1.34小时内完成了Wellcome Trust Case Control Consortium 2型糖尿病（WTCCC T2D）基因组数据的分析。可用性：GBOOST代码位于http://biologistics.ust.hk/BOOST.html#GBOOST（生物信息学） 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21372087 相关软件： 随机生存森林;CRAN（起重机）;gg随机森林;引导程序;随机森林SRC;ElemStatLearn（电子状态学习）;高级网络 引用于： 1文件 5位作者引用 1 达扎德，让·尤德斯 1 赫曼特·伊什瓦兰 1 拉杰夫·梅洛特拉 1 亚伦·温伯格 1 彼得·齐默尔曼 连载1篇 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文