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MetNetAligner公司

swMATH ID: 25791
软件作者: Cheng,Q.、Harrison,R.、Zelikovsky,A。
描述: MetNetAligner:代谢网络校准的web服务工具。高通量基因组、蛋白质组和代谢数据的积累使得代谢网络的建模和重建越来越准确。重构网络的对齐有助于捕捉模型不一致并推断缺失的元素。在本说明中,我们介绍了web服务工具MetNetAligner,它可以对齐代谢网络,同时考虑到网络拓扑的相似性和酶的功能。它可以用于预测未知路径、比较和发现保守模式以及解决酶的模糊识别。该工具支持多种对齐选项,包括允许或禁止酶删除和插入。它基于一种新的评分方案,该方案测量了酶与酶之间的功能相似性,并基于一种快速算法,该算法可以有效地找到从具有限制循环结构的有向图到任意有向图的最佳映射。可用性:MetNetAligner可用作web服务器,网址为:http://alla.cs.gsu.edu:8080/MinePW/pages/gmapping/GMMain.html。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19414533
相关软件: 4钛2;子MAP;CoMeta公司;凯格
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