简单化

基于SimpleITK的R图像分割、配准和特征描述。许多类型的医学和科学实验以图像的形式获取原始数据。各种形式的图像处理和图像分析被用来将原始图像数据转换为定量的度量,这些度量是后续统计分析的基础。在本文中,我们将描述simpleitkr包。SimpleITK是insight segmentation and registration toolkit(ITK)的简化接口。ITK是一个开源的C++工具包,在过去的18年里得到了积极的开发,并被医学图像分析社区广泛使用。SimpleITK为许多解释器环境提供了包,包括R。目前,它包括数百个用于图像分析的类,包括各种图像输入和输出、过滤操作和用于分割和注册的更高级别组件。使用SimpleITK,开发图像和统计分析程序的复杂组合是可行的。本文介绍了几个使用SimpleITK实现的计算图像分析任务的例子,包括球形标记定位、多模式图像配准、分割评估和细胞图像分析。