MetNet公司 swMATH ID: 25662 软件作者： Wurtele E、Li J、Diao L、Zhang H、Foster C、Fatland B、Dickerson J、Brown A、Cox Z、Cook D、Lee E、Hofmann H 描述： MetNet：构建和模拟拟南芥生物晶格的软件。MetNet公司(http://www.botany.iastate.edu/～mash/metnetex/metrobascnetex.html）是开发中的公共软件，用于分析全基因组RNA、蛋白质和代谢物分析数据。该软件旨在使生物学家能够可视化、统计分析和建模拟南芥的代谢和调控网络图，并结合基因表达谱数据。它包含一个到交互数据库（MetNetDB）的JAVA接口，其中包含来自网络数据库（TAIR、KEGG、BRENDA）组合的调控和代谢交互信息以及生物学家在其专业领域的输入。FCModeler以图形形式捕获MetNetDB的输入。可以使用简单的模糊认知图识别和解释子网络。FCModeler旨在开发和评估假设，并为评估高通量基因表达实验捕获的大量数据提供建模框架。FCModeler和MetNetDB目前正在扩展到三维虚拟现实显示。MetNet图以及基因表达数据可以使用GGobi中的多元图形工具和R中的数据分析工具进行查看。用户可以突出显示代谢网络的不同部分，并查看其他数据图中突出显示的相关表达数据。多维表达式数据可以通过不同的维度进行旋转。统计分析可以与可视化一起计算。MetNet旨在为制定有关特定基因功能的可测试假设提供一个框架，并从长远来看为确定控制植物组成和发育的代谢和调控网络提供基础。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2447407网址/ 相关软件： 细胞景观；生物导体；R（右）；格格作响；iSPlot软件；GTK公司+；rggobi公司；利马；RGtk2型；GGobi公司；勘探；简单；答对 了 引用于： 0个文档