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反应器FIViz

swMATH ID: 25625
软件作者: Wu,G。;道森,E。;Duong,A。;霍·R。;斯坦因,L。
描述: ReactomeFIViz:用于路径和基于网络的数据分析的Cytoscape应用程序。在现代生物学研究中,高通量实验是经常进行的。然而,从大量实验数据集中提取有意义的结果对生物学家来说是一项具有挑战性的任务。将数据投影到路径和网络上下文中是一种强有力的方法,可以解开嵌入在看似分散的大型数据集中的模式,并帮助发现与癌症和其他复杂疾病相关的知识。我们开发了一个名为“ReactomeFIViz”的Cytoscape应用程序,该应用程序利用高度可靠的基因功能相互作用网络,结合来自Reactome和其他通路数据库的人类管理通路。该应用程序提供了一系列功能,以帮助生物学家以生物直观和用户友好的方式执行基于路径和网络的数据分析。生物学家可以使用此应用程序揭示与其研究相关的网络和路径模式,从基因表达数据集搜索基因签名,在列表中揭示基因显著丰富的路径,并使用概率图形模型将多个基因组数据类型集成到路径上下文中。我们相信,我们的应用程序将为研究人员提供强大的能力来分析固有噪声的高通量实验数据,以找到生物相关信息。
主页: https://wiki.reactome.org/index.php/ReactomeFIViz
相关软件: 克林戈
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