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细胞NCA

swMATH ID: 25624
软件作者: Tang,Y。;李,M。;Wang,J。;潘,Y。;吴凤霞
描述: CytoNCA:用于蛋白质相互作用网络中心性分析和评估的细胞图插件。背景和范围:目前,中心性分析已成为识别生物网络中基本蛋白质的主要方法。在这里,我们介绍了CytoNCA,一个Cytoscape插件,它集成了多中心性度量的计算、评估和可视化分析。实施和性能:(i)CytoNCA支持八种不同的中心性度量,每种度量都可以应用于加权和未加权生物网络。(ii)它允许用户上传网络中节点和边缘的生物信息,将生物数据与拓扑数据集成以检测特定节点。(iii)CytoNCA提供了多个强大的可视化分析模块,可生成各种形式的输出,如图形、表格和图表,并分析所有度量之间的关联。(iv)可用于定量评估计算结果,并通过统计方法评估准确性。(v) 除了现有的八种中心性指标外,其他来源的生物学特性也可以通过CytoNCA进行分析和评估。这使得CytoNCA成为计算中心性、评估和可视化生物网络的优秀工具。可利用性:http://apps.cytoscape.org/apps/cytonca。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25451770
相关软件: 细胞控制分析仪DyNetViewer(动态网络查看器)完整的UniProt公司细胞景观FALCON公司TIIREC公司鲁万将军
引用于: 2文件

2篇连载文章中引用

1 物理报告
1 理论生物学杂志

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