LEA公司 swMATH ID: 25208 软件作者: 埃里克·弗里肖特(Eric Frichot);弗朗索瓦 描述: LEA:景观与生态关联研究的R包。LEA是一个致力于景观基因组学和生态关联测试的R包。LEA可以对种群结构进行分析,并对基因组进行扫描,以进行局部适应。它包括从大型基因型矩阵估计祖先系数和评估祖先种群数量(snmf,pca)的统计方法;识别与某些环境梯度或生态压力(lfmm)替代变量高度相关的遗传多态性,并控制错误发现率。LEA主要基于优化的C程序,可以根据超大数据集的维度进行扩展。 主页: https://bioconductor.riken.jp/packages/3.1/bioc/html/LEA.html 依赖项: R(右) 相关软件: 线性调频;bfa公司;跳跃;SpaceMix公司;弗拉佩;阿米戈;fastSTRUCTURE(快速结构);ANGSD公司;苔丝3r;结构;R(右) 引用于: 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 凯文·凯伊 1 奥利维尔·弗朗索瓦 1 杰伊,弗洛拉 1 马廷凤 1 米歇尔,奥利维尔·J·J。 1 王芳芳 2篇连载文章中引用 1 生物计量学 1 应用统计学年鉴 在1个字段中引用 2 统计学(62-XX) 按年份列出的引文