L1pred公司 swMATH ID: 25075 软件作者： 窦永超、王军、杨嘉良、张驰 描述： L1pred：一种基于序列的预测工具，用于使用L1-logreg分类器预测酶中的催化残留物。为了了解酶的功能，识别催化残基是通常的第一步。此外，有关催化残基的知识对蛋白质工程和药物设计也很有用。然而，由于时间和成本的原因，实验鉴定催化残留物仍然具有挑战性。因此，研究了预测催化残留物的计算方法。在这里，我们开发了一种新的算法L1pred，用于催化残渣预测，该算法使用L1-logreg分类器集成八个基于序列的评分函数。我们在精心设计的数据集Data604和Data63上测试了L1pred，并将其与几种现有的基于序列的方法进行了比较。通过十倍交叉验证，L1pred在训练数据集Data604上显示出精确再调用曲线下的面积（AUPR）和ROC曲线下的区域（AUC）分别为0.2198和0.9494。此外，在独立测试数据集Data63上，AUPR和AUC值分别为0.2636和0.9375。与其他基于序列的方法相比，L1pred在这两个数据集上表现出最佳性能。我们还分析了算法中每个属性的重要性，发现所有分数对L1pred性能的贡献大致相同。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC338704/ 相关软件： PSAIA公司;2结构;扎恩;洛里斯;UniProt公司;爆炸 引用于： 1文件 4位作者引用 1 考斯图布·德霍尔 1 苏坎塔·蒙达尔 1 Pai，Priyadarshini P。 1 古尔德普·辛格 连载1篇 1 理论生物学杂志 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文