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ABC-SysBio公司

swMATH ID: 24739
软件作者： Liepe，J.、Barnes，C.、Cule，E.、Erguler，K.、Kirk，P.、Toni，T.、Stumpf，M.P.H。
说明： ABC-SysBio：支持GPU的Python近似贝叶斯计算。动机：系统生物学领域的不断发展推动了对用于建模和模拟生物系统的灵活工具的需求。生物过程建模中的两个既定问题是模型选择和相关参数估计。已经提出了许多统计方法，包括频率论和贝叶斯方法来回答这些问题。结果：本文提出了一个Python包ABC-SysBio，它在近似贝叶斯计算（ABC）框架中实现了动态系统的参数推理和模型选择。它设计用于使用系统生物学标记语言（SBML）编写的模型。确定性和随机模型可以在ABC-SysBio中进行分析。可用性：http://abc-sysbio.sourceforge.net
主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20591907
依赖项： 蟒蛇
相关软件： 生物贝叶斯;天文ABC;EasyABC公司;科学Py;蟒蛇;车身控制模块;斯坦;达科塔;美国广播公司;铝3c;PyTorch公司;互平行;达克;IPython公司;pyABC公司;ELFI公司;SWIG（开关）;数字Py;阿帕奇火花;开放式多媒体接口
引用于： 6文件
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20位作者引用

1 乔治·阿兰帕齐斯
1 克里斯·巴恩斯（Chris P.Barnes）。
1 费尔南多·博纳西。
1 Economides，雅典娜·E。
1 萨拉·菲利皮
1 拉蒙·格里玛
1 彼得·希伯斯（Peter A.J.Hilbers）。
1 乔治·卡拉巴索斯
1 彼得·卡纳科夫
1 Petros D.库穆塔科斯。
1 法布里奇奥·雷森
1 塞尔吉奥·马丁。
1 吉多·桑吉内蒂
1 大卫·施诺尔
1 Michael P.H.Stumpf。
1 蒂曼，C.A。
1 范瑞尔，N.A.W。
1 范利尔，J。
1 丹尼尔·瓦尔切利
1 韦斯特，迈克
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6篇连载文章中引用

1 应用力学与工程中的计算机方法
1 数学生物科学
1 物理学报A：数学与理论
1 统计调查
1 统计与计算
1 贝叶斯分析
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在6个字段中引用

5 统计学（62-XX）
2 概率论与随机过程（60-XX）
2 数值分析（65-XX）
2 生物学和其他自然科学（92-XX）
1 常微分方程（34-XX）
1 运筹学、数学规划（90-XX）

按年份列出的引文