里昂 swMATH ID: 24616 软件作者: 汤普森,J.D.,普里金特,V.,波奇,O。 描述: LEON:邻居的多重环境评估。序列比对是广泛应用的基础,包括数据库搜索、功能残基识别和结构预测技术。这些应用程序基于对齐序列之间的假定同源性预测或传播结构/功能/进化信息。如果最初的同源性假设是错误的,那么任何后续应用,无论多么复杂,都不可能产生准确的结果。在这里,我们提出了一种新的方法,LEON,基于完整序列的多重比对(MACS)来预测蛋白质之间的同源性。在MACS中,来自远相关蛋白的微弱信号可以从家族的整体背景中考虑。中间序列和单个弱匹配的组合用于增加低得分区域的显著性。通过结合几种现有的检测成分偏倚序列片段的方法,还考虑了残留物组成。预测的准确性和可靠性在与结构和序列家族数据库的大规模比较中得到了证明,其中特异性大于99 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC390283/ 相关软件: AL2CO公司;BLAT(爆炸);拉根;法国皇家医学会;指南2;罢工;蛋白石;RASCAL公司;普罗瓦林;PCMA公司;充分满足;PMFastR项目;方面;莫韦;TCS(牵引力控制系统);合并对齐;装饰铝;国际RMSD;重新校准器;AlexSys公司 引用于: 1文件 2位作者引用 1 丹·德布拉西奥 1 John D.Kececioglu。 连载1篇 1 计算生物学 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文