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罢工

swMATH ID: 24609
软件作者: Carsten Kemena、Jean-Francois Taly、Jens Kleinjung、Cedric Notredame
描述: STRIKE:使用单个3D结构评估蛋白质MSA。动机:评估可供选择的多重蛋白质序列比对是生物学中一个尚未解决的重要问题。最准确的方法是使用结构信息。不幸的是,大多数方法都需要在对齐中嵌入至少两个结构,这是处理标准数据集时很少满足的条件。结果:我们开发了STRIKE,这是一种使用单一结构确定同一序列的两个备选比对的相对准确性的方法。我们在三个常用的参考数据集(BAliBASE、Homestrad和Prefab)上验证了我们的方法。给定两条路线,STRIKE成功确定了70条路线中最准确的一条
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC32373/
相关软件: 蛋白石;里昂;RASCAL公司;指南2;普罗瓦林;相变材料;充分满足;PMFastR项目;方面;莫韦;TCS(牵引力控制系统);合并对齐;装饰铝;国际RMSD;重新校准器;AlexSys公司;;探针Cons;UniProt公司;OXBench公司
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1 计算生物学

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