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合并对齐

swMATH ID: 24604
软件作者: 科林里奇,P.W.,凯利,S。
描述: MergeAlign是一个程序,它从多个独立的比对构建一致的多序列比对。使用动态编程,它可以有效地组合单个多序列比对,以生成最大程度代表所有成分比对的一致性。使用MergeAlign组合使用不同氨基酸替代矩阵生成的多个序列比对,可以生成比仅使用单个氨基酸替代矩阵产生的比对更健壮、更准确的多序列比对。从这些MergeAlign比对推断出的系统发生树具有更好的拓扑支持值、更好的分辨率和更高的一致性。MergeAlign为多序列对齐中的每个列生成列支持分数。当使用不同的氨基酸替代模型生成成分比对时,这些支持分数与比对精度相关。因此,MergeAlign可用于为下游系统发育应用程序选择精确对齐的数据。
主页: http://mergealign.appspot.com/
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引用于: 2文件

2篇连载文章中引用

1 计算机科学中的数学
1 计算生物学

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