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国际RMSD

swMATH编号: 24602
软件作者: Armougom F、Moretti S、Keduas V、Notredame C。
描述: iRMSD:使用结构信息对序列比对精度进行局部测量。我们介绍了iRMSD,这是一种新型的RMSD,它独立于任何结构叠加,适用于评估具有已知结构的蛋白质的序列比对。结果:我们证明了iRMSD相当于标准RMSD,尽管计算简单得多,并且我们还表明它适合于比较序列比对和基准多序列比对方法。我们在6个已建立的多序列比对包上测试了iRMSD评分,发现结果与使用已建立的参考比对集合(如Prefab)获得的结果一致。可用性:iRMSD是T-Coffee包的一部分,作为开源免费软件分发(网址:http://www.tcoffee.org/).
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16873492
依赖项: T-Coffee咖啡
相关软件: 指南2;罢工;蛋白石;里昂;RASCAL公司;普罗瓦林;PCMA公司;充分满足;PMFastR项目;方面;莫韦;TCS(牵引力控制系统);合并对齐;装饰铝;重新校准器;AlexSys公司;;探针Cons;UniProt公司;OXBench公司
引用于: 1文件

连载1篇

1 计算生物学

按年份列出的引文