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POSSUM公司

swMATH ID: 24532
软件作者: Wang,J。;杨,B。;Revote,J。;Leier,A。;马奎兹·拉戈,T.T。;网状物。;Lithgow,T。
描述: POSSUM:基于PSSM配置文件生成数字序列特征描述符的生物信息学工具包。位置特异性评分矩阵(PSSM)形式的进化信息是蛋白质序列的一种广泛使用且信息丰富的表示。因此,基于PSSM的特征描述符已成功应用于提高各种蛋白质属性预测因子的性能。尽管在以前的研究中已经提出了一些算法,但目前还没有通用的web服务器或工具包可用于生成这种种类繁多的描述符。在这里,我们介绍了POSSUM(用于机器学习的基于特定S取核矩阵的壮举生成器),这是一个多功能的工具包,具有在线网络服务器,可以生成21种类型的基于PSSM的特征描述符,从而满足生物信息学家和计算生物学家的关键需求。我们预计,该综合工具包将被广泛用作一个强大的工具,以促进基于机器学习模型的特征提取、选择和基准测试,从而为生物信息学研究提供更有效的分析和建模管道。可用性和实施:网址:http://possum.erc.monash.edu/ .
主页: http://possum.erc.monash.edu/help.jsp
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