TrpAQP公司 swMATH ID: 24381 软件作者： Dynowski，M。；美国卢德维格。 描述： TrpAQP：测定水通道蛋白选择性的计算机模拟。主要内在蛋白（MIP）家族的膜通道是水和溶质的孔。这种通道在几乎所有的生物体中都有，在植物中尤其丰富。实验证据表明，一些MIP是水通道蛋白，因此对水具有相对选择性。另一些则相反，能传导小溶质，如甘油、尿素或硼酸，因此被称为水甘油孔蛋白。一些MIP传导的溶质是孤立的气体，例如NH3。许多水通道蛋白的结构，包括一种来自植物的水通道蛋白，已经在分子水平上得到了解析，并且都具有类似的折叠。为了确定植物MIP选择性的分子决定因素，并确定与生理相关的迁移溶质，建立了一种基于计算机建模并结合实验验证的策略。对植物的MIP同源物进行同源建模，并应用各种模拟来测量它们对特定溶质（如氨和/或尿素）的电导。尿素在数量上是全世界使用的最重要的氮肥，因此它在植物中的运输备受关注。分子动力学模拟表明，特定的MIP对尿素和speci有偏好？c溶质如尿素和/或氨被输送。虽然溶质的大小和孔径对迁移很重要，但它们并不完全决定溶质是否被迁移。 主页： https://link.springer.com/章节/10.1007%2F978-3-540-36183-1_14 相关软件： NAMD公司 引用于： 1文件 标准条款 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 TrpAQP：测定水通道蛋白选择性的计算机模拟。 Zbl 1390.92173号达诺夫斯基，M。;美国卢德维格。 2007 2位作者引用 1 达诺夫斯基，M。 1 美国卢德维格。 0连载引用 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文