区域服务提供商 swMATH ID: 24067 软件作者： 缪政，曹毅，姜涛。 描述： RASP：蛋白质侧链构象的快速建模。动机：侧链构象建模是蛋白质结构建模、蛋白质对接和蛋白质设计中不可或缺的工作。由于对这一领域的深入关注，许多现有的程序可以实现相当好的可比预测精度。此外，在我们之前关于CIS-RR的工作中，我们认为用少量原子碰撞进行预测可以补充现有的蛋白质结构后续分析和精细化方法。然而，最近这些提高预测侧链质量的努力伴随着计算成本的显著增加。结果：在本研究中，我们主要着眼于提高侧链构象预测的速度，提出了一种RApid侧链预测因子，称为RASP。为了获得更快的速度和与现有最佳方法相当的精度，我们不仅采用了CIS-RR的冲突消除策略，还仔细优化了能量项并集成了不同的搜索算法。在综合基准测试中，RASP比最近开发的方法快一个数量级以上（是CIS-RR的40倍），同时达到了可比的甚至更好的精度。可用性：非商业用户可以在我们的网站上使用RASP：http://jianglab.ibp.ac.cn/lims/rasp/rasp 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/27/22/3117/195223 相关软件： 洛利；ASP公司；QTFier公司；SCWRL4号机组；BetaSCP公司；查姆；迷你球 引用于： 2文件 4位作者引用 1 斯特凡妮娅·科斯坦蒂尼 1 安德烈亚·福米萨诺 1 Kim、Deok-Soo 1 Ryu、Joonghyun 2篇连载文章中引用 1 全球优化杂志 1 应用非经典逻辑杂志 在3个字段中引用 1 数学逻辑和基础（03-XX） 1 计算机科学（68至XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文