BetaVoid公司 swMATH ID: 23975 软件作者: Jae-Kwan Kim、Youngsong Cho、Roman A.Laskowski、Seong Eon Ryu、Kokichi Sugihara、Deok-Soo Kim 描述: BetaVoid:通过β-络合物和Voronoi图的分子空隙。分子的外部结构对分子的功能很重要,表面和内部的空隙是最重要的特征之一。因此,识别分子空隙并准确计算其几何特性(如体积、面积和拓扑)至关重要,但大多数流行的算法都是基于对采样点的粗略使用,因此即使进行大量计算,也是近似的。在这篇文章中,我们提出了一种使用原子的Voronoi图和β络合物来解决这个问题的分析方法。从数学上证明了该算法的正确性和有效性,并进行了实验验证。基准测试清楚地表明了BetaVoid相对于两个流行程序的优势:VOIDOO和CASTp。该算法在Voronoi图研究中心免费提供的BetaVoid程序中实现(http://voronoi.hanyang.ac.kr). 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24677176 相关软件: QTFier公司;BetaConcept公司;BetaSCPWeb平台;CAVER公司;肥胖症;VRONI公司;LEDA公司;CGAL公司 引用于: 1文件 3位作者引用 1 金德秀 1 李莫昆 1 高基町杉原 连载1篇 1 ACM数学软件汇刊 在2个字段中引用 1 数值分析(65-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文