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姆特雷米克斯

swMATH编号: 23824
软件作者: Niko Beerenwinkel;Jörg Rahnenführer;罗尔夫·凯泽;丹尼尔·霍夫曼;约阿希姆·塞尔比格;托马斯·伦高
描述: Mtreemix:用于学习和使用诱变树混合模型的软件包。摘要:诱变树的混合模型构成了一类概率模型,用于描述以永久遗传变化积累为特征的进化过程。它们已被应用于建模肿瘤发展中染色体增益和损耗的积累以及HIV基因组中耐药相关突变的发展。Mtreemix是一个软件包,用于根据观察到的横截面数据估计诱变树木混合模型,并使用这些模型进行预测。我们提供模型拟合、模型选择、模拟、似然计算和等待时间估计的程序。可用性:Mtreemix,包括源代码、文档、示例数据文件以及预编译的Solaris和Linux二进制文件,可在以下网站免费供非商业用户使用:http://mtremix.bioinf.mpi-sb.mpg.de/
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/21/9/2106/409043
相关软件: R(右);基因二酚;三重MaxCut;气体;ProCAR项目;角度;NINJA公司;SVD请求;午睡;快速RFS;四重奏MaxCut;记录-I-DCM3;DACTAL公司;NJMerge公司;iGLASS系统;莫帕尔;ASTRID公司;巴克;HyDe公司;星熊2
引用于: 4文件

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