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Sfold公司

swMATH ID: 23820
软件作者: 丁毅、陈振英、劳伦斯CE
描述: Sfold web服务器用于核酸的统计折叠和合理设计。Sfold web服务器通过万维网(WWW)提供对Sfold的用户友好访问,Sfold是最近开发的核酸折叠软件包。该软件基于一种新的统计抽样范式,用于预测RNA二级结构。该软件的主要目标之一是为RNA靶向核酸的合理设计提供计算工具,其中包括用于基因敲除研究的小干扰RNA(siRNAs)、反义寡核苷酸和反式离合核酶。siRNA设计方法基于RNA靶可及性预测、siRNA双重热力学性质和经验设计规则的组合。我们的目标可及性评估方法是对底层RNA折叠算法的原始扩展,以解释目标mRNA可能存在的结构群体。除了Sirna、反义寡核苷酸和核酶的应用模块Sirna、Soligo和Sribo之外,Srna模块为采样结构的统计表示提供了全面的功能。所有模块都可以使用图形和文本格式的详细输出。Sfold服务器位于http://sfold.wadsworth.orghttp://www.bioinfo.rpi.edu/applications/fold。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15215366
相关软件: 百万倍;DINAMelt公司;法国皇家医学会;RSEACH公司;RNA形状;寡核苷酸阵列;RandPS公司;爆破;PSI-爆炸;基因卡;iHOP公司;通用航空公司;KineFold公司;JASPAR公司;PipMaker软件;C查找器;RNAsoft软件;HotKnots(热结);GenRGenS公司;gfun公司
引用于: 12文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
Sfold web服务器用于核酸的统计折叠和合理设计。
丁,叶;Chan、Chi Yu;查尔斯·劳伦斯。
2004

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