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FFTbor公司

swMATH ID: 23803
软件作者: Senter,E;谢赫,S;多图,我;庞蒂,Y;克洛特,P
描述: 使用快速傅里叶变换加速RNA构象开关的计算搜索。利用复数单位根和快速傅里叶变换,我们设计了一种新的基于热力学的算法FFTbor,该算法可以计算给定RNA序列的任意初始结构与碱基对不同的二级结构的玻尔兹曼概率。该算法在四次时间和二次空间中运行,用于确定动力学折叠速度与能量景观的稳健性之间的相关性,并预测候选核糖开关表达平台的位置。web服务器位于http://生物信息学.bc.edu/clotelab/FFTbor/。
主页: http://bioinformatics.bc.edu/clotelab/FFTbor/index.spy
相关软件: 维也纳RNA;NNDB公司;MODENA(莫德纳);MSBuilder(MSBuilder);ERD公司;KFOLD公司;RNA表达次数;FFT或2D;法国皇家医学会
引用于: 2文件
更多出版物: http://bioinformatics.bc.edu/clotelab/FFTbor/index.spy?tab=references

标准条款

1出版物描述软件 年份
文摘:使用快速傅里叶变换加速RNA构象开关的计算搜索
埃文·森特(Evan Senter);沙阿德·谢赫;伊凡·多图;扬·蓬蒂;彼得·克洛特
2013

2篇连载文章中引用

1 数学生物学杂志
1 理论计算机科学

按年份列出的引文