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SurvBoost公司

swMATH ID: 23772
软件作者: 艾米莉·莫里斯(Emily Morris)、何凯文(Kevin He)、李彦明(Yanming Li)、李毅(Yi Li)和康健(Jian Kang)
描述: SurvBoost:一个R包,用于通过梯度提升在分层比例危险模型中选择高维变量。比例风险模型中的高维变量选择在不同领域有许多成功的应用。实际上,数据可能涉及不满足PH假设的混杂变量,在这种情况下,可以采用分层比例风险(SPH)模型通过混杂变量的分层来控制混杂效应,而无需直接建模混杂效应。然而,SPH模型中缺乏用于高维变量选择的高效统计软件。在这项工作中,开发了一个R包SurvBoost,以实现梯度推进算法,用于用高维协变量和其他混杂因素拟合SPH模型。大量仿真研究表明,与现有的R包相比,SurvBoost在许多情况下可以实现更好的选择精度,并大大减少计算时间,该包实现了无分层的boosting算法。在癌症基因组图谱(TCGA)研究中,对具有生存结果的基因表达数据的分析也说明了所提出的R包。此外,还提供了SurvBoost的详细实践教程。
主页: https://arxiv.org/abs/1803.07715
依赖项:
关键词: arXiv_状态.COarXiv_发布R包分层比例危险SPH公司SPH模型梯度增强
相关软件: RcppArmadillo公司卢比Rcpp并行姆博斯特
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标准条款

1出版物描述软件 年份
SurvBoost:基于梯度提升的分层比例风险模型中高维变量选择的R包arXiv公司
艾米莉·莫里斯(Emily Morris)、何凯文(Kevin He)、李彦明(Yanming Li)、李毅(Yi Li)和康健(Jian Kang)
2018