Hy3S公司 swMATH ID: 23355 软件作者: H.Salis、V.Sotiropoulos、Y.N.Kaznessis 描述: Hy3S–超级计算机的混合随机模拟。Hy3S现在是一个更大项目的一部分,SynBioSS是一个合成生物学软件套件。SynBioSS利用Hy3S进行模拟,但围绕其包装了一个跨平台用户界面。SynBioSS还包括两个基于web的软件,以帮助设计和创建模拟模型文件。SynBioSS和Hy3S的持续开发将在SynBioSS网站上记录。Hy3S(发音为hi-thre-ess)是一个开源项目,旨在开发、集成和传播能够尽快模拟化学或生物化学系统的软件,使用混合或其他近似算法大大减少计算时间,但仍保持准确性。我们对有趣的生物设备的计算设计感兴趣,特别是那些依赖调节基因表达来产生有用行为的设备。通过将定量预测模拟和设计算法相结合,人们最终将能够使用计算机识别产生所需功能的准确DNA序列,从而大大减少必要的实验工作量。当然,这一目标需要成熟的模拟算法,本项目旨在提供这些算法。使用本软件时,请引用以下参考文献:H.Salis、V.Sotiropoulos、Y.N.Kaznessis、BMC生物信息学,v7 p93(2006) 主页: http://hysss.sourceforge.net/ 相关软件: 科帕西;DASSL公司;URDME公司;生物-PEPA;GreatSPN公司 引用于: 5文件 全部的 前5名15位作者引用 2 西尔瓦娜·伊利 1 阿莱西奥·安吉乌斯 1 詹弗兰科·巴尔博 1 马可·贝库蒂 1 恩里科·比博纳 1 曹、杨 1 陈明翰 1 奥古斯丁·谢瓦利埃 1 斯特凡·恩格布洛姆 1 韦恩·恩赖特。 1 安德拉斯·霍瓦思 1 Kenneth R.杰克逊。 1 蒙珠·莫舍德 1 罗伯塔·西罗维奇 1 王朔 5篇连载文章中引用 1 数学生物学通报 1 SIAM数值分析期刊 1 理论计算机科学 1 数值算法 1 应用数学杂志 在5个字段中引用 4 概率论与随机过程(60-XX) 4 生物学和其他自然科学(92-XX) 2 数值分析(65-XX) 1 常微分方程(34-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文