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绑定数据库

swMATH ID: 23141
软件作者： Liu T、Lin Y、Wen X、Jorrise RN、Gilson MK
描述： BindingDB：实验测定的蛋白质与蛋白质结合亲和力的网络数据库。绑定数据库(http://www.bindingdb.org网站)是一个可公开访问的数据库，目前包含约20000个实验测定的蛋白质-甘氨酸复合物结合亲和力，110个蛋白质靶点，包括异构体和突变变体，以及约11000个小分子配体。这些数据是从科学文献中提取的，数据收集的重点是作为药物靶点或候选药物靶点的蛋白质，其结构数据存在于蛋白质数据库中。BindingDB网站支持一系列查询类型，包括按化学结构、子结构和相似性进行搜索；蛋白质序列；配体和蛋白质名称；亲和力范围和分子量。BindingDB查询生成的数据集可以以带注释的SDfile的形式下载，以供进一步分析，也可以用作虚拟筛选用户上传的复合数据库的基础。BindingDB中的数据通过PDB ID和化学和序列搜索链接到PDB中的结构数据，并通过PubMed ID链接到PubMed.中的文献。
主页： https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
相关软件： ChEMBL公司;KEGG公司;ImageNet公司;火炬IO;TensorLy公司;美国残疾人协会;夹点网;深度亲和力;掌中宽带;科尼亚语;深度DTA;MNIST公司;CIFAR公司;PyTorch几何;PyTorch闪电;火炬视觉;MLlib（MLlib）;Scikit公司;货币市场基金;玉米粉
引用于： 4出版物

标准条款

1出版物描述软件 年份
Bindingdb：实验测定的蛋白质与蛋白质结合亲和力的网络数据库。
刘体清；林玉梅；文欣；Robert N.Jorissen。；迈克尔·吉尔森。
2007
全部的 前5名

17位作者引用

1 安娜·玛丽亚·阿梅里科
1 埃莉诺·加德纳。
1 瓦莱丽·吉列。
1 马西耶·哈兰茨克
1 杰罗姆·埃尔特
1 约翰·霍利迪。
1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。
1 蓝、薇
1 努鲁尔·马利姆
1 潘毅
1 约根德拉·帕特尔
1 马可·图通
1 阿莱西亚·维尔兹
1 王建新
1 彼得·威利特（Peter K.Willett）。
1 吴方祥
1 严，程

4篇连载文章中引用

1 复杂性
1 统计分析与数据挖掘
1 理论生物学杂志
1 分子生物学方法

在5个字段中引用

三 生物学和其他自然科学（92-XX）
1 总体主题；集合（00-XX）
1 统计学（62-XX）
1 计算机科学（68至XX）
1 系统论；控制（93至XX）

按年份列出的引文