匹配 swMATH ID: 23010 软件作者: Kel AE、Gossling E、Reuter I等人 描述: MATCH:在DNA序列中搜索转录因子结合位点的工具。Match是一种基于权重矩阵的工具,用于搜索DNA序列中假定的转录因子结合位点。Match与TRANSFAC数据库紧密相连并分布在一起。特别地,Match使用在TRANSFAC中收集的基质库,因此提供了搜索各种不同转录因子结合位点的可能性。系统中构建了多组优化的矩阵截止值,以提供不同严格程度的各种搜索模式。用户可以构建并保存他/她的特定用户配置文件,这些用户配置文件是选定的矩阵子集,包括默认或用户定义的截止值。此外,还提供了一些由TRANSFAC团队编制的组织特异性档案。Match工具的公共版本位于:http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html#match。可以在以下位置找到具有不同web界面的相同程序http://comport.bient.nsc.ru/Match/Match.html。名为Match Professional的工具的高级版本位于http://www.biobase.de。 主页: http://www.bioinfo.de/isb/gcb01/poster/gossling.html 相关软件: TRANSFAC公司;JASPAR公司;RDP2号机组;PhyloBayes 3;分区查找器;克里蒂卡;TICO公司;合奏休息;MOCAT公司;生物之星;ClustalW公司;序列视觉;黄金;多射频;贝叶斯先生;国际GTP;TOPAL公司;ExaBayes公司;叮当声;后勤分配 引用于: 3文件 全部的 前5名6位作者引用 1 乔纳森·基思(Jonathan M.Keith)。 1 耿林 1 林,瓦莱丽·C·L。 1 辛齐亚·皮齐 1 玛丽亚·斯蒂芬诺娃。 1 埃斯科·乌科宁 3篇连载文章中引用 1 理论计算机科学 1 计算生物学和化学 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文