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swMATH ID: 23010
软件作者: Kel AE、Gossling E、Reuter I等人
描述: MATCH:在DNA序列中搜索转录因子结合位点的工具。Match是一种基于权重矩阵的工具,用于搜索DNA序列中假定的转录因子结合位点。Match与TRANSFAC数据库紧密相连并分布在一起。特别地,Match使用在TRANSFAC中收集的基质库,因此提供了搜索各种不同转录因子结合位点的可能性。系统中构建了多组优化的矩阵截止值,以提供不同严格程度的各种搜索模式。用户可以构建并保存他/她的特定用户配置文件,这些用户配置文件是选定的矩阵子集,包括默认或用户定义的截止值。此外,还提供了一些由TRANSFAC团队编制的组织特异性档案。Match工具的公共版本位于:http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html#match。可以在以下位置找到具有不同web界面的相同程序http://comport.bient.nsc.ru/Match/Match.html。名为Match Professional的工具的高级版本位于http://www.biobase.de。
主页: http://www.bioinfo.de/isb/gcb01/poster/gossling.html
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