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H模拟器

swMATH ID: 22841
软件作者: 卢卡·马切蒂(Luca Marchetti);罗萨里奥隆巴多;科拉多·普里亚米
描述: H模拟器:生化反应网络的混合随机/确定性模拟。HSimulator是一个多线程模拟器,用于放置在混合良好的环境中的大规模生物化学反应系统。HSimulator提供了一组广泛的最先进的随机、确定性和混合仿真策略的优化实现,包括基于混合拒绝的随机仿真算法(HRSA)的第一个公开可用的实现。HRSSA是迄今为止最快的混合算法,可以有效地模拟模型,同时确保准确模拟反应网络模型的子集。基准测试表明,HSimulator通常比其他考虑的模拟器快得多。该软件运行在Java v6.0或更高版本上,提供了用于建模和可视化探索生物过程的模拟GUI,以及支持自定义应用程序开发的Javadoc文档Java库。HSimulator根据COSBI共享源代码许可协议(COSBI-SSLA)发布。
主页: http://www.cosbi.eu/research/prototypes/hsimulator
关键词: 混合随机/确定性仿真;生化反应网络;基于混合拒绝的随机仿真算法(HRSSA)
相关软件: HRSSA公司;步骤;科帕西
引用于: 2文件

2篇连载文章中引用

1 数学生物学通报
1 复杂性

按年份列出的引文