H模拟器 swMATH ID: 22841 软件作者: 卢卡·马切蒂(Luca Marchetti);罗萨里奥隆巴多;科拉多·普里亚米 描述: H模拟器:生化反应网络的混合随机/确定性模拟。HSimulator是一个多线程模拟器,用于放置在混合良好的环境中的大规模生物化学反应系统。HSimulator提供了一组广泛的最先进的随机、确定性和混合仿真策略的优化实现,包括基于混合拒绝的随机仿真算法(HRSA)的第一个公开可用的实现。HRSSA是迄今为止最快的混合算法,可以有效地模拟模型,同时确保准确模拟反应网络模型的子集。基准测试表明,HSimulator通常比其他考虑的模拟器快得多。该软件运行在Java v6.0或更高版本上,提供了用于建模和可视化探索生物过程的模拟GUI,以及支持自定义应用程序开发的Javadoc文档Java库。HSimulator根据COSBI共享源代码许可协议(COSBI-SSLA)发布。 主页: http://www.cosbi.eu/research/prototypes/hsimulator 关键词: 混合随机/确定性仿真;生化反应网络;基于混合拒绝的随机仿真算法(HRSSA) 相关软件: HRSSA公司;步骤;科帕西 引用于: 2文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 H模拟器:生化反应网络的混合随机/确定性模拟。 Zbl 1380.90204号卢卡·马切蒂;罗萨里奥·伦巴多;科拉多·普里亚米 2017 4位作者引用 1 罗萨里奥·伦巴多 1 卢卡·马切蒂 1 科拉多·普里亚米 1 Vo Hong Thanh先生 2篇连载文章中引用 1 数学生物学通报 1 复杂性 在2个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 运筹学、数学编程(90-XX) 按年份列出的引文