iSNO-PseAAC公司 swMATH编号: 22446 软件作者: Xu,Y。;丁,J。;Wu,L.-Y。;周,K.-C。 描述: iSNO PseAAC:通过将位置特异性氨基酸倾向纳入伪氨基酸组成来预测蛋白质中的半胱氨酸S-亚硝基化位点。蛋白质的翻译后修饰(PTM)负责传感和转导信号,以调节各种细胞功能和信号事件。S-亚硝基化(SNO)是最重要和最普遍的PTM之一。随着后基因组时代产生的蛋白质序列雪崩,迫切需要开发计算方法来及时识别蛋白质中的准确SNO位点,因为这类信息对于基础研究和药物开发都非常有用。在这里,开发了一种新的预测因子,称为iSNO-PseAAC,通过将位置特异性氨基酸倾向(PSAAP)纳入伪氨基酸组成的一般形式(PseAAA)来识别蛋白质中的SNO位点。预测器使用条件随机场(CRF)算法实现。作为演示,构建了一个基准数据集,其中包含731个SNO站点和810个非SNO站点。为了减少同源性偏差,这些位点都不是从具有[公式:见正文]配对序列同一性的蛋白质中衍生出来的。据观察,iSNO-PseAAC在独立数据集上识别亚硝基化蛋白质的总体交叉验证成功率超过90 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23409062 相关软件: iRSpot-PseDNC公司;国际RSpot-TNCPseAAC;财产;iLoc-Hum公司;iNuc-PhysChem;综合布线;PseAAC-建筑商;iSNO-AAP航空公司;iRNA心理健康;iAMP-2L型;伦敦银行支持向量机;iPPI-Esml接口;邻硝基-Tyr;iNuc-PseKNC;iPTM毫升;iMethyl-PseAAC(异甲基苯丙酮);PseKNC公司;iRSpot-EL接口;iPro54-PseKNC;iHSP-PseRAAAC系统 引用于: 40文件 全部的 前5名134位作者引用 5 肖宣 4 周国成 3 马苏德·海亚特 3 贾建华 2 谢丽尔·勃拉纳姆 2 亚历山德拉·卢米尼 2 马志强 2 洛丽斯·南尼 2 宁、乔 2 邱、王仁 2 邱文英 2 于斌 2 赵小伟 1 沙希德·阿克巴 1 安纪勇 1 Vo V.安。 1 穆罕默德·阿里夫 1 穆罕默德·雷扎·巴赫蒂亚利扎德 1 曼达纳州贝巴哈尼 1 卞永涛 1 曹俊哲 1 曹,伙计 1 曹天杰 1 柴、海亭 1 陈,程 1 陈国栋 1 陈浩文 1 陈伟 1 程翔 1 Chong,Kil To村 1 崔晓文 1 邓乃阳 1 丁慧 1 丁、军 1 丁亚欣 1 丁兆堂 1 杜俊伟 1 曼苏尔·易卜拉希米 1 伊斯梅尔·易卜拉希米 1 范国良 1 费文超 1 冯、彭敏 1 傅毅 1 巴赫拉姆·戈利艾 1 顾红红 1 关、孟月 1 郭新云 1 佐里·哈吉沙里菲 1 韩国胜 1 韩立斌 1 他,平安 1 塔姆吉杜尔·霍克 1 胡建辉 1 胡雪海 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 苏梅亚伊克巴尔 1 Jan,扎胡尔 1 朱哲 1 苏塞因·卡亚 1 阿西福拉·汗 1 Khan,Muazam Ali先生 1 穆赫塔吉·汗 1 可汗,穆斯林 1 扎赫尔·乌拉·汗 1 拉文德拉·库马尔 1 班达纳库马里 1 龚孙源 1 李、陈 1 李,春 1 李倩忠 1 李珊 1 李晓燕 1 李、熊 1 李雪鹏 1 廖波 1 林浩 1 林,你好 1 刘冰翔 1 刘,子 1 马,秦 1 阿明·马达卡·索巴尼 1 Man-Wai Mak 1 马库布尔,H.F。 1 梅,胡安 1 闵建良 1 哈桑·穆罕默德 1 马吉德·穆罕默德·贝吉 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆罕默德·莫拉迪·沙赫巴巴克 1 穆亚双 1 牛晓辉 1 Pai,Priyadarshini P。 1 潘露露 1 安吉洛·帕韦西 1 彭庆科 1 彭彦军 1 梅因·皮里亚耶 1 阿米尔·马苏德·拉希米 1 穆罕默德·索赫尔·拉赫曼 1 萨布,M.法兹利 …还有34位作者 引用于3个系列 38 理论生物学杂志 1 数学生物科学与工程 1 医学中的计算和数学方法 全部的 前5名在6个字段中引用 40 生物学和其他自然科学(92-XX) 12 计算机科学(68至XX) 7 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 测量和集成(28-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 按年份列出的引文