GOASVM公司 swMATH ID: 22445 软件作者: Wan,S.,Mak,M.W.,Kung,S.Y。 描述: GOASVM:一种亚细胞位置预测因子,通过将术语频率基因本体论纳入Chou伪氨基酸组成的一般形式。蛋白质亚细胞定位预测是一个重要而又具有挑战性的问题。最近,人们提出了几种基于基因本体(GO)的计算方法来解决这一问题,并证明了其优于基于其他特征的方法。然而,现有的基于GO的方法并没有充分利用GO信息。本文提出了一种称为GOASVM的高效GO方法,该方法利用GO项频率和远距离同源物的信息来表示Chou伪氨基酸组成的一般形式的蛋白质。该方法首先选择相关GO项的子集来形成GO向量空间。然后,对于每个蛋白质,该方法使用该蛋白质的登录号(AC)或其同源物的登录号来查找基因本体注释(GOA)数据库中选定GO术语的出现次数,作为构建GO向量以进行支持向量机(SVM)分类的手段。利用GO项频率的优势和一种新的合并有用同源信息的策略,GOASVM可以达到72.2的预测精度 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23376577 相关软件: 位置传感器;iLoc-Gpos公司;iRSpot-PseDNC公司;欧盟-mPLoc;工厂-mPLoc;iLoc-Hum公司;iLoc-Virus病毒;iLoc-工厂;iEzy-药物;iSNO-AAP航空公司;iLoc-Euk公司;国际RSpot-TNCPseAAC;沃尔夫PSORT;Gneg-mPLoc公司;iNuc-PhysChem;邻硝基-Tyr;iSNO-PseAAC公司;iCTX类型;iSS-PseDNC公司;iLoc-动物 引用于: 6文件 全部的 前5名12位作者引用 三 龚孙源 三 Man-Wai Mak 三 万世彪 1 程翔 1 周国成 1 黄超 1 姜伟 1 吕英丽 1 肖宣 1 杨磊 1 袁景奇 1 左永春 连载1篇 6 理论生物学杂志 在2个字段中引用 6 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文