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iMethyl-PseAAC(异甲基苯丙酮)

swMATH ID: 22443
软件作者: 邱伟荣。;Xiao,X。;林伟珍(Lin,W.Z.)。
描述: iMethyl-PseAAC:通过伪氨基酸组成方法鉴定蛋白质甲基化位点。在成为生物合成过程中的天然蛋白质之前,由核糖体翻译mRNA创建的多肽链将经历一系列“生成”步骤,如切割、折叠和翻译后修饰(PTM)。蛋白质中PTM的知识对于各种人类疾病的动态蛋白质组分析和表观遗传至关重要。最重要的PTM之一是精氨酸或赖氨酸上分别发生的精氨酸甲基化或赖氨酰甲基化。给定一种蛋白质,其精氨酸(或赖氨酸)的哪个位点可以甲基化,哪个位点不能甲基化?这是深入了解甲基化机制和药物开发的首要问题。随着后基因组时代产生的蛋白质序列雪崩,其紧迫性已不言而喻。为了解决这个问题,我们提出了一种新的预测器,称为iMethyl-PseAAC。在预测系统中,肽样品由346维载体配制而成,该载体将其物理化学、序列进化、生化和结构紊乱信息整合到伪氨基酸组成的一般形式中。通过严格的折刀试验和独立数据集试验观察到,iMethyl-PseAAC在该领域优于任何现有预测因子。
主页: https://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/947416/
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