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AFP-Pred公司

swMATH ID: 22441
软件作者: Kandaswamy,K.K。;马丁内茨,T。;莫勒,S。;Suganthan,P.N。;Sridharan,S。;普盖伦西,G。
描述: AFP-Pred:一种从序列衍生特性预测抗冻蛋白的随机森林方法。一些生活在极低温度下的生物可以产生一些称为“抗冻蛋白”(AFP)的特殊物质,可以防止细胞和体液冻结。AFPs存在于脊椎动物、无脊椎动物、植物、细菌、真菌等中。尽管AFPs具有共同的功能,但它们在序列和结构上表现出高度的多样性。因此,基于序列相似性的搜索方法通常无法从序列数据库中预测AFP。在这项工作中,我们报告了一种随机森林方法“AFP-Pred”,用于从蛋白质序列预测抗冻蛋白。AFP-Pred在包含300个AFP和300个非AFP的数据集上接受训练,并在包含181个AFP与9193个非AFPs的数据集中进行测试。AFP-Pred达到81.33
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2056045
相关软件: 位置传感器;iLoc-Euk公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iDNA蛋白质;iSNO-PseAAC公司;iPPI-Esml接口;iRSpot-EL接口;国际RNA-AI;iPPBS-光学;iPro54-PseKNC;pSuc-Lys公司;iLoc-Virus病毒;iRSpot-PseDNC公司;财产;俄罗斯皇家空军;iPTM-mLys公司;iCar-PseCp公司;2L-piRNA;iHSP-PseRAAAC系统;pLoc-工厂
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