iRSpot-PseDNC公司 swMATH ID: 22437 软件作者: Chen,W。;冯,P.-M。;Lin,H。;周,K.-C。 描述: iRSpot-PseDNC:识别假二核苷酸组成的重组点。减数分裂重组是一个重要的生物学过程。作为进化的主要驱动力,重组提供了遗传变异的自然新组合。减数分裂重组不是在基因组中随机发生,而是在一些频率较高的基因组区域(所谓的“热点”)和频率较低的其他区域(所谓“冷点”)进行。因此,热点和冷点的信息将为深入研究重组机制和基因组进化过程提供有用的见解。到目前为止,重组区域主要是通过实验确定的,这既昂贵又耗时。随着后基因组时代产生的基因组序列雪崩,人们迫切希望开发出快速有效识别重组区域的自动化方法。在本研究中,开发了一个名为“iRSpot-PseDNC”的预测因子,用于识别重组热点和冷点。在新的预测器中,DNA序列样本是由一种新的特征载体,即所谓的“伪二核苷酸组成”(PseDNC)配制的,其中包含了六种局部DNA结构特性,即三个角度参数(扭曲、倾斜和滚动)和三个平移参数(移位、滑动和上升)。通过严格的折刀试验观察到,iRSpot-PseDNC获得的总成功率>82 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23303794 相关软件: iSNO-PseAAC公司;综合布线;PseKNC公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iNuc-PseKNC;财产;iPro54-PseKNC;伦敦银行支持向量机;iLoc-Hum公司;iSNO-AAP航空公司;iRNA-PseColl基因;pSuc-Lys公司;iPPI-Esml接口;PseAAC生成器;iPTM-mLys公司;iNuc-PhysChem;pLoc-动物;国际RNA-AI;iRSpot-EL接口;2L-piRNA 引用于: 65文件 全部的 前5名203位作者引用 5 周国成 4 肖轩 三 杜普峰 2 谢丽尔·勃拉纳姆 2 埃内斯托·孔特拉斯·托雷斯 2 阿卜杜拉·德赞吉 2 曼苏尔·易卜拉希米 2 马苏德·海亚特 2 塔姆吉杜尔·霍克 2 苏梅亚伊克巴尔 2 贾建华 2 焦亚森 2 李红 2 梁云云 2 亚历山德拉·卢米尼 2 詹姆斯·莱昂斯(James E.Lyons)。 2 约瓦尼,马雷罗·蓬奇 2 苏坎塔·蒙达尔 2 洛丽斯·南尼 2 宁,乔 2 Pai,Priyadarshini P。 2 Paliwal,Kuldip K。 2 邱文英 2 阿洛克·夏尔马 2 杨磊 2 杨连平 2 于斌 2 张强 2 张胜利 2 张向德 2 赵晓青 2 赵晓伟 2 郑燕 2 左永春 1 谢赫·阿迪利纳 1 贾马尔·艾哈迈德 1 法曼·阿里 1 伊萨亚斯·阿尔瓦拉多。 1 萨伊德·阿米里 1 安纪勇 1 阿南德·安巴拉苏 1 Vo V.安。 1 阿兰、雷扎·佐胡里 1 苏西米塔·巴格 1 穆罕默德·雷扎·巴赫蒂亚利扎德 1 斯蒂芬·巴里杰。 1 曼达纳州贝巴哈尼 1 卞永涛 1 尼埃拉·比斯沃斯 1 苏林·波 1 蔡璐 1 曹俊哲 1 曹,伙计 1 曹天杰 1 纳斯罗拉·莫加达姆·查卡里 1 陈,程 1 陈国栋 1 陈浩文 1 陈伟 1 程翔 1 Chong,Kil To村 1 内斯托尔·库比兰 1 崔晓文 1 蒂塔拉吉·达什 1 丁慧 1 丁兆堂 1 伊沃·迪诺夫。 1 杜俊伟 1 伊斯梅尔·易卜拉希米 1 范国良 1 马里兰州Dewan Farid 1 费文超 1 冯、彭敏 1 傅浩跃 1 傅毅 1 高,杨 1 塞萨尔·R·加西亚·加卡斯。 1 雅米拉加西亚 1 巴赫拉姆·戈利艾 1 法希梅·戈尔扎里 1 顾红红 1 郭新云 1 佐里·哈吉沙里菲 1 韩国胜 1 韩立斌 1 何平安 1 里斯·赫夫南 1 胡建辉 1 胡学海 1 黄超 1 瓦卡尔侯赛因 1 赛义德·贾利利 1 梅伦·贾米勒 1 纪金超 1 贾苍志 1 贾、云 1 姜伟 1 朱哲 1 苏塞因·卡亚 1 阿米尔·侯赛因·卡瓦约 …还有103位作者 2篇连载文章中引用 64 理论生物学杂志 1 医学中的计算和数学方法 全部的 前5名在7个字段中引用 65 生物学和其他自然科学(92-XX) 22 计算机科学(68至XX) 15 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 测量和集成(28-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文